Kursen primära syfte är att studenterna ska förvärva djupare insikter om och färdigheter i grundläggande koncept och verktyg för jämförande sekvensanalys, inkluderande olika typer av primära och sekundära sekvensdatabaser. Kursen ingår i masterprogrammet i Bioinformatik Kursen BINP17 kan läsas i kombination med kursen BINP16 Programmering i Python7.5 hp och ingår i masterprogrammet i bioinformatikBioinformatics, the application of computational methods to biological and biomedical problems, is a rapidly growing field. Modern biochemists and biologists need to have a basic knowledge of bioinformatics. This course provides both a practical and a theoretical overview of database searching, sequence alignment, phylogenetic analysis, gene prediction and genome analysis. BINP17 can be taken eith

I kursen ingår sammanfogning av genom-, transkriptom- och amplikondata samt en första analys av resultaten i form av genprediktion (för genom), samt expressionsanalys (för transkriptom). Gener och transkript annoteras på en grundläggande nivå. Studenterna genomför flera övningar i hur kommandoskal fungerar samt ett flertal programmeringsuppgifter i Python. Under kursen genomförs en individuell proThis hands on course will give you the experience and provide the tools that are needed to analyze next generation sequencing data. It is particularly focused on the analysis of: transcriptome data amplicon data genome data Working environment is Linux and the course will develop the students’ skills in Bash and Python. Covered areas are: assemblies differential expression varia

Efter assemblering av data, genererade med nya sekvenseringsmetoder såsom ”next generation sequencing”, måste resultatet knytas till den bakomliggande biologiska frågeställningen. Det innebär att den fortsatta analysen kommer att kräva olika bioinformatiska metoder. Kursen ger exempel på ett stort antal bioinformatiska tillämpningar för att besvara olika frågeställningar, t.ex. klassificering av gAfter assembling of data, generated by new sequencing methods such as "next generation sequencing", the results must be linked to the underlying biological questions. It implies that the subsequent analysis will require different bioinformatics methods. The course gives example of a large number of bioinformatics applications to answer different issues e.g. classification of genetic variants ("var

Kursen omfattar planering, genomförande och redovisning av en del av ett forskningsprojekt. Projektet ska ha anknytning till bioinformatisk utbildning. Kursen ingår i Masterprogrammet i BioinformatikIn this courses, you learn how to plan and carry out a project in Bioinformatics from start to end. The course is open for students on the Master's programme in Bioinformatics  

Kursens övergripande mål är att den studerande med stor självständighet skall genomföra ett vetenskapligt projekt inom ett väl definierat bioinformatiskt ämnesområde. Vi erbjuder masterexamensarbete i bioinformatik omfattande 30, 45 eller 60 högskolepoängYou can perform a Master's Degree project of 30 (BINP50), 45 (BINP51) or 60 (BINP52) credits in Bioinformatics. To be able to apply for a Master´s Degree Project in Bioinformatics you should be enrolled in the Masters Program in Bioinformatics at Lund University, and should have completed 45 credits of relevant advanced level courses within the programme.  

Kursens övergripande mål är att den studerande med stor självständighet skall genomföra ett vetenskapligt projekt inom ett väl definierat biologiskt ämnesområde. Du kan göra ett masterexamensarbete i biologi omfattande 30, 45 eller 60 högskolepoäng.You can perform a Master's Degree project of 30, 45 or 60 credits in either General Biology, or one of the specializations Animal Ecology, Aquatic Ecology, Conservation Biology or Plant Science. To be able to do a Master´s Degree Project in Biology you should be enrolled in the Master´s Program in Biology at Lund University, and should have completed 45 credits of relevant advanced level courses

Mikroberna är jordens osynliga majoritet. De finns i stort sett överallt där vi hittar flytande vatten och deras aktiviteter påverkar starkt alla andra livsformer. Vilken del av biologin du än specialiserar dig mot är kunskaper om mikroorganismerna viktiga. Deras betydelse inom t.ex. medicin, livsmedelsindustri, bioteknik och som molekylärbiologiska modellorganismer är välkänd, men mikrobiologin hMicrobes are the unseen majority on earth. They are found essentially everywhere where there is liquid water and their activities strongly affect all other forms of life. Whatever part of biology you are specialising in, knowledge about microorganisms is valuable. Their importance in e.g. medicine, food industry, biotechnology, and as model organisms in molecular biology is well known, but microbi

Kursen ger inblick i sinnenas funktion och betydelse för djurens beteenden samt exemplifierar djurens kommunikation. Kursen behandlar syn och annan ljusreception; lukt; smak; hörsel; balanssinne; mekanoreception; elektroreception; magnetoreception samt sinnen för temperatur och infraröd strålning. Samtliga sinnen studeras jämförande över djurriket.The course deals with vision and other types of photoreception, olfaction, taste, hearing, equilibrium, mechanoreception, pressure reception, electroreception, magnetoreception and senses for temperature and heat radiation. All senses are studied comparatively across the animal kingdom. A range of methods in physiology, ethology and human psychophysics are taught and used during the course.

Kursen fokuserar på att du skall lära dig grundläggande teori och förståelse för de viktigaste molekylära genetiska metoderna som används i moderna ekologiska och evolutionära forskningsprojekt. Centralt är att förstå betydelsen av genetisk variation för artbildning, populationsdifferentiering och individers anpassningar till olika miljöer, så som adaptationer mellan värd och parasit. Efter kursenIn this course you will learning basic theory and understanding of the most important molecular genetic methods used in modern ecological and evolutionary research projects. Central is to understand the importance of genetic variation for speciation, population differentiation and adaptations of individuals to different environments, for example adaptations between hosts and their parasites. After

Kursen är en avancerad kurs i Ekologi och kan ses som en del i en utbildning inom naturvård. Övergripande målsättning för kursen är att studenterna ska lära sig att med minimal tid i fält skaffa sig maximal kunskap om naturen med utgångspunkt i vad det insamlade materialet skall användas till. Övervakning av naturen innebär i sin strängaste betydelse att undersökaren vet vilken förändring som kan The main objective of this course is that you learn to optimise time in the field in order to obtain maximum information about the conditions and status of the natural environment. Monitoring of nature is based on that the investigator knows what change is expected and can construct a programme, including collection of data and material, which can detect a particular change. You may also do a gene

Kursen har som mål att ge kännedom om ekotoxikologiska teorier, modeller, problemställningar och arbetsmetoder. Vi behandlar teorier och modeller rörande toxikologiska testmetoder och endpoints, fördelnings-, spridnings-, och fugacitetskoncept, bioackumulering och biomagnifiering. Ekotoxikologiska effekter studeras på olika organisationsnivåer, biokemisk-fysiologisk, cell, organism, populatioThis course is aiming to provide understanding and practical knowledge of the fate, uptake and effects of anthropogenic pollutants in the environment. We study and apply ecotoxicological theories, models, and common methods and approaches concerning: fate of pollutants in the environment using fugacity based multimedia partitioning models; uptake and accumulation using models of bioconcentration a

Kursen är en avancerad kurs i ekologi och fokuserar på artkunskap, metodik och grundläggande ekologi om fåglar. Kursen bygger på lärande av metoder för att studera fåglar i fält, fältbestämning av fåglar (med avseende på igenkänning av arter mha utseende och sång) samt teori om fåglars morfologiska, fysiologiska och ekologiska anpassningar. Mer specifikt innebär fältstudierna att du lär dig grundeThis is an advanced course in ecology that focuses on species identification, methodology and basic ecology about birds. The course is based on learning the basic skills about techniques for studying birds in the field (including visual identification and identification on vocalizations), as well as theoretical moments about bird morphology, physiology and ecological adaptations. More specifically

Kursen är en avancerad kurs i ekologi och beskriver hur man tillämpar de ekotoxikologiska teorierna som inhämtats på kursern BIOR41, Ekotoxikologi i yrkes- och forskningsverksamhet. Övergripande mål är att förstå och identifiera ekotoxikologins roll i samhället och att träna på att använda sina ekotoxikologiska kunskaper för att lösa samhällsproblem orsakade av kemikalieanvändning. Kursen består aThis course is an advanced course in biology aiming to provide understanding and practical knowledge of how ecotoxicological theories and models are applied and implemented by different stakeholders in society, mainly outside academia. An overall aim is to identify the role of ecotoxicology in society and to practice use of your knowledge of ecotoxicology to resolve issues or problems caused by th

Antibiotika är mycket viktiga substanser. Merparten av alla kända antibiotika kommer från bakterier. Antibiotika har betraktats som nästan perfekta läkemedel men användningen begränsas genom att bakterier utvecklar antibiotikaresistens. Den ökande förekomsten av multi-resistenta mikroorganismer utgör ett stort hot. Kursen inriktar sig på grundläggande frågeställningar rörande antibiotika. Vilken bAntibiotics are very important compounds. The majority of all known antibiotics are produced by bacteria. Antibiotics were once regarded as miracle drugs. However, they are becoming less effective as bacteria develop resistance against them. The increasing occurrence of micro-organisms that are resistant to multiple antibiotics constitutes a serious threat to human health. The course addresses fun

Neurobiologi är ett internationellt stort forskningsområde på gränsen mellan biologisk grundforskning och medicinskt tillämpning. Vår kurs ger en introduktion i ämnet som du kan bygga på med andra mer specialiserade kurser, ett eget examensarbete, egen forskning eller ett jobb i ett av de stora biomedicinska företagen. Samtidigt, även om du inte vill fortsätta i ämnet, så får du en gedigen överbliNeurobiology is an internationally important research field where biological basic research and medical research come very close. We teach an introductory course that will allow you to continue with more specialized courses, a degree project and start your own research or get a position in one of the large biomedical companies. At the same time, if you do not want to specialize in this field, the

Bakterier utgör grunden för biosfären och är en förutsättning för allt liv på jorden. Denna kurs ger insikter i hur gener är organiserade och reglerade i bakterier och deras virus. Kursen omfattar molekylärbiologiska aspekter av gener, proteiner, proteinkomplex och andra biomolekyler som ger struktur och upprätthåller organismens funktioner. Användningen av genteknik och moderna tekniker såsom ”trBacteria make up the foundation of the biosphere and sustain all life on earth. This course provides insights into how genes are organised and regulated in bacteria and in their viruses. The course comprises molecular biology of genes, proteins, multicomponent protein complexes, and other biomolecules that provide structure and perform the organism’s functions. The use of genetic engineering and m

Kursens ger kunskaper om vatten som naturresurs; sjöars och rinnande vattens produktionsförhållanden; vattnets kretslopp och näringsämnesbalans; hydrologi; vattenreningsteknik; akvatisk mikrobiologi samt sjörestaurering. Vidare studeras vattenvårdsproblem som utsläpp av avloppsvatten och eutrofiering; utdikning och sjösänkning; sjöreglering; igenväxning samt försurning. Aktuell miljölagstiftning oThis course aims to integrate theoretical knowledge within aquatic ecology and hydrology to be used within practical water management. Thus, it is an applied course, and through a combination of lectures, practical training, seminars, group projects, field trips and study visits you will obtain a thorough knowledge of the areas that you are supposed to master when working within water management.

Kursen är en avancerad kurs i Ekologi och fokuserar framför allt på populations- och samhällsekologisk teoribildning. Ekologiska teorier om bland annat konkurrens, predation, spridning, trofiska interaktioner och succession behandlas dels på föreläsningar och dels på seminarier på läroboken och vetenskapliga artiklar. Förutom att ge insikter i ekologisk teori syftar kursen till att ge en ökad försThis is an advanced course, focused on the theoretical background of population and community ecology. Various topics such as competition, predation, community ecology and trophic interactions are treated in lectures, article seminars and a literature project. The course aims to give a deeper understanding of how to formulate hypotheses, design studies and analyse the data that result from these s

I den här kursen lär du dig mer om funktionell och strukturell uppbyggnad av växter på organism, organ- och cellnivå. Du får lära dig mer om växters olika livsprocesser och hur dessa samverkar samt om växters grundläggande utvecklingsfaser och vad som styr dem.In this course you will acquire a deep knowledge and understanding of how plants function at different levels of organization, from molecular biology to ecophysiological level, including: the structure and properties of cells, the life processes and their regulation, genome structure, function and evolution, and plant development and reproduction systems. knowledge of practical applications

Visste du att en spade trädgårdsjord innehåller minst lika många arter som det finns i en tropisk regnskog ovan jord? På kursen i mark- och växtekologi studerar du hur kemiska/ fysikaliska faktorer i marken påverkar dessa arter (markdjur och mikrober) . Vi studerar också interaktioner mellan växterna och markorganismerna samt vilken betydelse dessa interaktioner har för t.ex. näringscirkIn the soil and plant ecology course we explore the intersection of biological, chemical, and geological processes that shape the soil environment. In an era of unprecedented human-induced environmental change, research in this field is advancing rapidly. The course explores the processes underlying biogeochemical cycles of carbon and nutrients, soil formation and erosion, and we examine how human